Tổ Chuyên môn Trường THPT Ngô Quyền gồm các tổ sau đây: Tổ Toán – Tin Tổ Vật Lý – Công Nghệ Tổ Hóa Học – Sinh Học Tổ Lịch Sử – Địa Lý Tổ Ngữ Văn – Giáo dục kinh tế pháp luật Tổ Thể Dục – QPAN Tổ Ngoại Ngữ
